《崩坏三》的主线剧情从第一章“黄昏少女战舰”一直延续到第六章“巴比伦的囚徒”,在这段时间里,玩家可以自由选择并使用自己喜欢的角色。
从第七章“向天举起叛逆之剑”开始,一直到第二十五章“点燃明日的火焰”,由于《崩坏三》独特的世界观已初步形成,为了保证剧情顺利推进和玩家良好的故事体验,在这段时间内玩家只能使用规定好的试用角色进行战斗。
不过,在第二十六章开始后,《崩坏三》开启了开放世界篇章,玩家又可以重新使用自己喜欢的角色了。
《崩坏三》中能够使用自己喜欢角色进行战斗的章节有:第一至六章以及第二十六至三十一章。